274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1093 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  100 
 
 
426 aa  878    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  47.52 
 
 
375 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  27.11 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  26.99 
 
 
372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  29.32 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.42 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  26.9 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  25.62 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
375 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  26.86 
 
 
373 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  29.19 
 
 
375 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.48 
 
 
376 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
375 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  26.14 
 
 
373 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  27.35 
 
 
369 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  24.01 
 
 
377 aa  99.8  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  25 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
378 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
358 aa  96.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.6 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  25.57 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  24.07 
 
 
689 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.93 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.76 
 
 
354 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
396 aa  94  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.46 
 
 
402 aa  93.6  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  25 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  24.78 
 
 
384 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24.43 
 
 
688 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.78 
 
 
361 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  25.58 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  26.88 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  26.93 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  21.91 
 
 
387 aa  90.5  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  24.11 
 
 
374 aa  89.7  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  22.63 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  26.39 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.09 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  24.33 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  24.86 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  24.26 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  24.72 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  22.39 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.98 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.73 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  23.98 
 
 
478 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.27 
 
 
368 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.86 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  20.87 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.22 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.57 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  24.42 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  25.42 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.24 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  24.82 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.02 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.88 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  23.18 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.72 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  29.07 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  25.27 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.91 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.09 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  24.02 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.51 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  22.33 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  22.49 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.38 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.56 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  24.13 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  24.13 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.1 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  21.39 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  22.25 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  22.33 
 
 
338 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  22.33 
 
 
338 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.33 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  27.67 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.06 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.12 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.51 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.87 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.41 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>