217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1823 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  100 
 
 
366 aa  734    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  36.24 
 
 
372 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  39.73 
 
 
373 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  37.71 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  38 
 
 
401 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  38.76 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  40.55 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  38 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  39.89 
 
 
373 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  37.8 
 
 
384 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  36.54 
 
 
386 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  35.71 
 
 
375 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  38.48 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  35.71 
 
 
370 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  39.26 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  37.09 
 
 
375 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  39.26 
 
 
358 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  35.22 
 
 
374 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  35.75 
 
 
373 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  35.55 
 
 
403 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.2 
 
 
375 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  34.68 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  35.11 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  34.88 
 
 
381 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.67 
 
 
362 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  34.08 
 
 
369 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  34.82 
 
 
375 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  31.48 
 
 
378 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  37.11 
 
 
386 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  37 
 
 
370 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.76 
 
 
376 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.04 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  35.51 
 
 
381 aa  193  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  34.29 
 
 
373 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
372 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  33.54 
 
 
369 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  34.64 
 
 
396 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  32.53 
 
 
390 aa  185  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  34.72 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  35.28 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  34.55 
 
 
393 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  31.4 
 
 
377 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  34.44 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  32.3 
 
 
373 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  31.96 
 
 
688 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.3 
 
 
367 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  31.93 
 
 
337 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
689 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  33.03 
 
 
359 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
351 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
361 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  28.27 
 
 
344 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
375 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
353 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.14 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
371 aa  92.8  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
349 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
350 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.31 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.97 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  24.7 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.14 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  22.8 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
389 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  22.38 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.98 
 
 
389 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  24.59 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.98 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  23.87 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  22.18 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.3 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  27.25 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.25 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  24.87 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.8 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.81 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.91 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  26.3 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  20.74 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.21 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  26.11 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  23.34 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  22.77 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.23 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>