188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1092 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  771    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  61.28 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  58.2 
 
 		 381 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 337 aa  277  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  36.97 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  36.97 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  36.5 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  38.85 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  36.39 
 
 		 370 aa  239  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  35.81 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  37.14 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  38.18 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  36.01 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.34 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  35.86 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.86 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 386 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  36.65 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  36.25 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  35.05 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  33.08 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  35.73 
 
 		 365 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  35.81 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 374 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  34.75 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  36.34 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.78 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  33.94 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  37.17 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  34.72 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  34.62 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  31.73 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.99 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.42 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  31.86 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 688 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 689 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  23.22 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.06 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.72 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.05 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  21.93 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.98 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.42 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.8 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.04 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.44 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.49 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.06 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  23.56 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  20.8 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.26 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  23.17 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  23.17 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  22.16 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  21.85 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>