More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0388 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  100 
 
 		 396 aa  798    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  90.4 
 
 		 393 aa  707    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  85.88 
 
 		 689 aa  595  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  85 
 
 		 688 aa  593  1e-168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  72.67 
 
 		 409 aa  521  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  50.29 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  44.13 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  43.88 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  42.34 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  44.12 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  45.75 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  45.97 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  45.56 
 
 		 373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  45.43 
 
 		 373 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  43.44 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  41.64 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  39.77 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  38.89 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  38.52 
 
 		 373 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  39.18 
 
 		 365 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  41.07 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.6 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  39.3 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  37.65 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  34.01 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  33.76 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  37.64 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  37.57 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  32.67 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  38.63 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  37.46 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.05 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  36.89 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  38.39 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  36.52 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  38.35 
 
 		 362 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  34.42 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  32.75 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.57 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  33.92 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  34.01 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  34.95 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  31.67 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.83 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  33.83 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  32.83 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  30.48 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  27.93 
 
 		 378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  30.84 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.78 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 682 aa  93.6  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 682 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  29.44 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  30.54 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 315 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.45 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.98 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.35 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  22.34 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 723 aa  86.7  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  28 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.14 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  23.94 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.4 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.01 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.87 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25.9 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.63 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.63 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  23.86 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>