More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1702 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  100 
 
 
364 aa  738    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  60.11 
 
 
365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  50.14 
 
 
407 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  44.07 
 
 
368 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  42.7 
 
 
360 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  37.01 
 
 
429 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  36.13 
 
 
363 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  35.85 
 
 
363 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.56 
 
 
384 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30.86 
 
 
427 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  31.44 
 
 
375 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  32.18 
 
 
373 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
375 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  30.57 
 
 
373 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
377 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  30.89 
 
 
378 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  32 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  30 
 
 
378 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.01 
 
 
383 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  29.91 
 
 
392 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  29.3 
 
 
381 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  29.3 
 
 
389 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.07 
 
 
406 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  29.3 
 
 
389 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
375 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  29.3 
 
 
365 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.35 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  29.51 
 
 
370 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.94 
 
 
377 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  28.41 
 
 
383 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  31.64 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
370 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  25 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  28.98 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.98 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
368 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  25.99 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  30 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  29.24 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  28.87 
 
 
394 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25.71 
 
 
377 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.56 
 
 
401 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.82 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  26.87 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  27.2 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  24.86 
 
 
382 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  27.65 
 
 
367 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  25.49 
 
 
380 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  23.74 
 
 
375 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  28.76 
 
 
380 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.66 
 
 
483 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.51 
 
 
375 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  29.77 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 
478 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  28.45 
 
 
517 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  28.8 
 
 
344 aa  96.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.7 
 
 
366 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
361 aa  96.3  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  26.49 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.53 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  30.51 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  29.48 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  23.04 
 
 
363 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.66 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.9 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.96 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  23.92 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  27.57 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.79 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  30.51 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  27.38 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  28.81 
 
 
689 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  27.58 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.45 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
688 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  27.37 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  24.72 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.61 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  23.5 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.33 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  28.19 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  23.41 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  23.1 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  24.78 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  30.58 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>