240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2328 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  100 
 
 		 384 aa  778    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  89.24 
 
 		 384 aa  640    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  63.73 
 
 		 401 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  63.22 
 
 		 401 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  62.07 
 
 		 375 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  60.31 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  48.56 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  49.06 
 
 		 370 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  48.77 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  47.34 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  47.37 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  40.64 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  42.62 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  41.29 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  41.24 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  39.63 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  39.73 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  44.58 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  40.63 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  39.73 
 
 		 365 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.74 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.99 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  39.54 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.92 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  39.95 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  41.19 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  39.95 
 
 		 375 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  40.89 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  42.11 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  41.67 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.64 
 
 		 369 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  38.69 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  38.01 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  37.79 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  37.92 
 
 		 366 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  40.87 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  37.96 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  36.48 
 
 		 390 aa  226  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  37.99 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  36.57 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  36.05 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 396 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  37.18 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  33.95 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  34.05 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  35.81 
 
 		 688 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  35.9 
 
 		 689 aa  203  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  36.12 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  32.21 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  32.24 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.67 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.38 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 350 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.69 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.2 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.61 
 
 		 478 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.76 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.65 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 343 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.55 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.55 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.07 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.85 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.6 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.4 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.64 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.4 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  22.34 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>