More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2078 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  100 
 
 		 327 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  38.28 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 682 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 682 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  29.69 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.38 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.19 
 
 		 344 aa  92.8  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  25 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  23.05 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  27.31 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  25.8 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  23.3 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  22.35 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  23.21 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.15 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  23.46 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.42 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  24.67 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.7 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.4 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  27.49 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.44 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 688 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  22.18 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  21.64 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  23.34 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  23.8 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  24.09 
 
 		 700 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  24.17 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 409 aa  72.4  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  24.47 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  23.14 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.58 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.6 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  21.95 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.33 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  22.07 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  24.06 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  28.51 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.48 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_27  iron ion ABC transporter, periplasmic component  26.27 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0380632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  23.91 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.91 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  26.81 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  22.05 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>