More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1187 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 374 aa  770    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  51.35 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  34.39 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  33.55 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  32.31 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  31.69 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  30.43 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.63 
 
 		 386 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  31.72 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  30.12 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  32.63 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  30.96 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  29.91 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  27.81 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  29.09 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.46 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.3 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 345 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  30.18 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.23 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  29 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  27 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.33 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  27.33 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  29.33 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.69 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  29.57 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.47 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.45 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  25.68 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  28.07 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.54 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  25 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 344 aa  96.3  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.94 
 
 		 344 aa  96.3  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  23.67 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  22.06 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.21 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 352 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  23.2 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  26.83 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>