127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1515 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  100 
 
 		 345 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  36.88 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  37.21 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  31.86 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  31.94 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  31.95 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  36.39 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  32.25 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.74 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.94 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  28.98 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  31.13 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  29.7 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.7 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.99 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  31.43 
 
 		 363 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  28.21 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  32.57 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  24.27 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  30.86 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.51 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  31.14 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  28.72 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  30.93 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  24.26 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.9 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.62 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  25 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  21.53 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  20.32 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  25.4 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  26.87 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  26.17 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.13 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.39 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.14 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  21.24 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  24.76 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  23.37 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  28.5 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  21.58 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.46 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  31.48 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  29.61 
 
 		 592 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.72 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10530  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.88 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1157  periplasmic binding protein  31.37 
 
 		 104 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.56 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.89 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>