289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0603 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  100 
 
 		 348 aa  710    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  40.45 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  41.04 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  35.19 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.83 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  32.77 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.11 
 
 		 349 aa  208  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  34.95 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  35.28 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  34.23 
 
 		 362 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  32 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  33.56 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  30.26 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  34.19 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  33.01 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  33.01 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  33.61 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  34 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  29.92 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  34.19 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  31.41 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  30.35 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.86 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  31.17 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  30.42 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  31.75 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  28.61 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  31.08 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.6 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  25 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.1 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  26.26 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  28.8 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  32.39 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 315 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.17 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  23.34 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  32.18 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.1 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  31.19 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  29.28 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.06 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  27.44 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  29.44 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  23.74 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.92 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.02 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  31.03 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  26.97 
 
 		 580 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>