240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0278 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  100 
 
 		 331 aa  670    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  41.04 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  39.03 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.16 
 
 		 357 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  35.07 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  34.94 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  31.31 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  32.9 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  32.5 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  31.17 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.29 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  31.95 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  31.11 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  31.13 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 376 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  30.35 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.35 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  30.23 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  28.43 
 
 		 365 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 353 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  31.27 
 
 		 370 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.96 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  30.1 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  28.75 
 
 		 378 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 382 aa  95.9  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.05 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  24.16 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  28.46 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.19 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  22.54 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.16 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.81 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.18 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.47 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.1 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.94 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.77 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.8 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.69 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.69 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  25.29 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.42 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  28.79 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.3 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 689 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.86 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.86 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>