289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0033 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  100 
 
 		 351 aa  730    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  44.92 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  45.19 
 
 		 353 aa  322  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  42.9 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  40.24 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  40.06 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  28.4 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  32.05 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.63 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  30.42 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  30.3 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.74 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  31.66 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.11 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  32.64 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  31.46 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.35 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.29 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.5 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  30.12 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.28 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 358 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10530  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.91 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 376 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.84 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  29.15 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.08 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  29.88 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  28.18 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.29 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  28.35 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  27.11 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  24.93 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  25.34 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  27.61 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 682 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  26.48 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  28 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.61 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 682 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.25 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.15 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.65 
 
 		 427 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  28.25 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 419 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  25.88 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.45 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.73 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  28.31 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  26.65 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  27.69 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.08 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>