238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1176 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 408 aa  849    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  51.21 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  46.39 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  46.27 
 
 		 408 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  36.21 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  27.98 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 377 aa  99.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 374 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  22.72 
 
 		 333 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  28.45 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.83 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.65 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.6 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.21 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.87 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  25.06 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.94 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.64 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  25.39 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  26.05 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.15 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  22.69 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.45 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.61 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  23.87 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.54 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.27 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.41 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  25.63 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  24.27 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.08 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.45 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  27.35 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.23 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.65 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  22.4 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  21.68 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  24.66 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  21.09 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  25.44 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.14 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.78 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.14 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  25.06 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  21.58 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  21.27 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  23.67 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  24.83 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  22.16 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.9 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  23.62 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  20.51 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>