More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1492 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  90.88 
 
 
375 aa  660    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  88.4 
 
 
375 aa  664    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  100 
 
 
362 aa  739    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  75.41 
 
 
375 aa  591  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  54.29 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  42.12 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  44.84 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  42.12 
 
 
373 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  42.12 
 
 
373 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  44.12 
 
 
358 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  39.78 
 
 
372 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  41.27 
 
 
401 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  40.43 
 
 
401 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  41.38 
 
 
381 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  40.73 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  42.57 
 
 
384 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  41.38 
 
 
376 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.21 
 
 
373 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  38.48 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  36.89 
 
 
374 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  41.07 
 
 
384 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  39.41 
 
 
369 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.34 
 
 
370 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  37.67 
 
 
365 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  36.31 
 
 
374 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  39.44 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  35.95 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  37.16 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  39.3 
 
 
387 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  39.16 
 
 
337 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  37.4 
 
 
378 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  37.39 
 
 
370 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  36.68 
 
 
370 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.86 
 
 
367 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  35.08 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  35.55 
 
 
381 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  37.4 
 
 
366 aa  210  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  37.4 
 
 
386 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.92 
 
 
369 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  38.12 
 
 
396 aa  204  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.05 
 
 
688 aa  202  5e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  36.77 
 
 
689 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  37.31 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  38.01 
 
 
393 aa  199  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  36.36 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  34.44 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  33.06 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  31.3 
 
 
374 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.66 
 
 
359 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  31.2 
 
 
366 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  28.45 
 
 
375 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
354 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
354 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.13 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.88 
 
 
344 aa  122  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
375 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.79 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
350 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  29.04 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
351 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.77 
 
 
363 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  29.89 
 
 
362 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  28.37 
 
 
365 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  29.51 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  27.75 
 
 
376 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
333 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.68 
 
 
354 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  27.97 
 
 
369 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.09 
 
 
408 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  27.95 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
348 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
349 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
350 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
354 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  30.52 
 
 
334 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  29.81 
 
 
406 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
380 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.69 
 
 
361 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.87 
 
 
483 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  28.44 
 
 
360 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
371 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
353 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
354 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
351 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.83 
 
 
342 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.98 
 
 
370 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  25 
 
 
352 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.02 
 
 
346 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  27.32 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  26.12 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.35 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.05 
 
 
368 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.71 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.35 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>