More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0494 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  100 
 
 
390 aa  789    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  50.13 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  41.28 
 
 
374 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  40.87 
 
 
373 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  41.39 
 
 
374 aa  278  8e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  40.42 
 
 
365 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  43.52 
 
 
369 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  42.06 
 
 
372 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  46.2 
 
 
358 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  42.41 
 
 
378 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  45.61 
 
 
358 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  41.34 
 
 
373 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.96 
 
 
374 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  39.59 
 
 
373 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  37.53 
 
 
386 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  39.02 
 
 
401 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  42.31 
 
 
381 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  37.87 
 
 
401 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  38.02 
 
 
373 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.53 
 
 
370 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  37.24 
 
 
403 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  38.03 
 
 
377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  38.21 
 
 
387 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.88 
 
 
369 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  38.29 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  38.94 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  39.38 
 
 
384 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  37.64 
 
 
396 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  37.19 
 
 
689 aa  216  5e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38.28 
 
 
376 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  36.39 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.32 
 
 
688 aa  215  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  38.98 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  38.15 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  38.6 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  36.15 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  34.29 
 
 
375 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  37.07 
 
 
393 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  37 
 
 
362 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.51 
 
 
375 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  36.09 
 
 
370 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  36.73 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  34.29 
 
 
381 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  36.25 
 
 
386 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  38.91 
 
 
373 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  32.53 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.09 
 
 
367 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  34.15 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  32.8 
 
 
378 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  31.17 
 
 
344 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
375 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  30.33 
 
 
354 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.13 
 
 
354 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.43 
 
 
354 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
354 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.38 
 
 
333 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
354 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.48 
 
 
363 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.1 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
350 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
350 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
350 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  25.62 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  26.28 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.8 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.75 
 
 
427 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  28.2 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.16 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  23.87 
 
 
349 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  23.18 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.04 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.18 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.39 
 
 
360 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25.39 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.17 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
348 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  24.7 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  25 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.29 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.94 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.29 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  27.35 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  22.39 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  25.86 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  26.13 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  23.54 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  24.69 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  24.16 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  24.16 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>