249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1091 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  682    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  50.74 
 
 
376 aa  324  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  45.75 
 
 
381 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  42.86 
 
 
378 aa  277  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  42.11 
 
 
403 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  41.28 
 
 
401 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  41.86 
 
 
401 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  40.41 
 
 
373 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  39.65 
 
 
387 aa  235  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  42.48 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  39.47 
 
 
370 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  40.53 
 
 
386 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  40.87 
 
 
384 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  39.31 
 
 
373 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  38.94 
 
 
370 aa  228  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  39.16 
 
 
362 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  39.71 
 
 
372 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  39.7 
 
 
386 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  40.5 
 
 
370 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.04 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.3 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  37.68 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  37.75 
 
 
374 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  38.66 
 
 
358 aa  219  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.46 
 
 
374 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.35 
 
 
369 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  39.53 
 
 
375 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  36.63 
 
 
369 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  36.6 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.61 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  37.03 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  37.23 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  37.43 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  39.13 
 
 
378 aa  212  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  34.93 
 
 
375 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  34.11 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  36.73 
 
 
390 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  34.97 
 
 
381 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  35.73 
 
 
369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  32.24 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  33.73 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  32.83 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  31.93 
 
 
366 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  32.56 
 
 
373 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.63 
 
 
367 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
688 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
689 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  31.02 
 
 
374 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
359 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
334 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
354 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
354 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
354 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.2 
 
 
344 aa  102  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.75 
 
 
353 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  29.75 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.87 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  23.26 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.01 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.51 
 
 
349 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
350 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
350 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.85 
 
 
427 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.65 
 
 
351 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  22.73 
 
 
350 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.39 
 
 
333 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  22.42 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26.11 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  27.87 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.29 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.29 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  27.53 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  24.6 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  25.99 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.71 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.67 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  22.02 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.69 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.7 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.6 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.77 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.72 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  24.76 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  24.13 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.25 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  27.64 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>