More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1286 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 370 aa  767    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  78.05 
 
 		 365 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  46.72 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  48.17 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  47.02 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  42.04 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  40.4 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  40.12 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  36.86 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  38.27 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  37.12 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  34.47 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  35.09 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  33.13 
 
 		 363 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.4 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  34.02 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  34.95 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  32.09 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  32.83 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.13 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.84 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  31 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.51 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  30.68 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  32.51 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  31.41 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  31.18 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  30.33 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  27.41 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  31.52 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  30.94 
 
 		 331 aa  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  29.41 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.05 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 342 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.91 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  30.32 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.87 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.47 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.9 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.74 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.98 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.96 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  25.99 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  27.22 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.21 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.33 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  31.77 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  23.71 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  22.61 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  33.58 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.64 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.14 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>