More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1687 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  100 
 
 		 378 aa  785    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  65.03 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  52.27 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  40.65 
 
 		 376 aa  315  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  42.35 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  39.84 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  36.66 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  36.69 
 
 		 369 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  38.53 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  40.37 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  38.29 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  37.43 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  37.85 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  38.36 
 
 		 348 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  36.76 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  34.88 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  36.84 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.1 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  37.95 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.36 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  37.54 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  36.02 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  36.34 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  34.48 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  36.34 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  36.14 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  34.86 
 
 		 352 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  33.85 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  34.16 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  31.61 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  33.12 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  30.64 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.19 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  32.19 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  34 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  32.25 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  36.54 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  31.17 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 324 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  31.1 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.23 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  28.02 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.02 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.46 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  28.66 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.22 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.57 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.04 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  28.5 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.79 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.87 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  27.15 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.65 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  28.31 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.5 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.42 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  29.32 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  26.18 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.3 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.86 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  32.45 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  24.67 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 315 aa  96.3  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.06 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.03 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>