281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1470 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  100 
 
 		 419 aa  855    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  56.96 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  45.93 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  43.8 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  40.81 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.98 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.56 
 
 		 333 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  26.87 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 375 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.42 
 
 		 349 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  27.12 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.86 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  23.82 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  26.26 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.81 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  22.99 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  24.94 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.34 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.62 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  29.17 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.7 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 682 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.72 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.83 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  27.05 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.11 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  24.18 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.73 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  25.06 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  22.56 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.3 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  22.97 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  27.39 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.83 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  22.2 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  23.22 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  21.01 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.63 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  22.13 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  21.36 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>