280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0496 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  100 
 
 
372 aa  749    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  63.17 
 
 
386 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  61.83 
 
 
373 aa  495  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  59.95 
 
 
373 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  51.61 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  51.8 
 
 
373 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  50.54 
 
 
374 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  50.42 
 
 
365 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  52.84 
 
 
358 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  52.54 
 
 
358 aa  362  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  46.9 
 
 
374 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  47.85 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  49.6 
 
 
378 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  51.06 
 
 
369 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  49.58 
 
 
372 aa  343  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  44.57 
 
 
381 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  43.4 
 
 
370 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  40.8 
 
 
369 aa  289  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  43.84 
 
 
401 aa  288  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  42.41 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  43.82 
 
 
384 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  44.06 
 
 
403 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  44.54 
 
 
384 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  43.48 
 
 
370 aa  271  9e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  42.26 
 
 
409 aa  271  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  41.73 
 
 
373 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  37.14 
 
 
370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  42.06 
 
 
390 aa  264  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  39.43 
 
 
387 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  42.82 
 
 
377 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  41.64 
 
 
396 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  38.85 
 
 
375 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  38.32 
 
 
375 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  38.79 
 
 
375 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  40.88 
 
 
362 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.53 
 
 
375 aa  255  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  37.36 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  40.36 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  36.24 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  38.76 
 
 
688 aa  243  6e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  38.76 
 
 
689 aa  241  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  40.77 
 
 
373 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38.06 
 
 
376 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  36.05 
 
 
381 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  35.84 
 
 
386 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  37.68 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.95 
 
 
367 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.05 
 
 
378 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  36.48 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.72 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.99 
 
 
426 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.64 
 
 
354 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  28.15 
 
 
365 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
350 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  27.98 
 
 
408 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
350 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
350 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.69 
 
 
483 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.76 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
350 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.95 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.36 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.79 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.92 
 
 
370 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  22.83 
 
 
371 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.3 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.21 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
354 aa  90.5  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.24 
 
 
368 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  24.78 
 
 
378 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  26.24 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.6 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  25.23 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.15 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  25.98 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  26 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.27 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  23.82 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  22.96 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  25.71 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.9 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.16 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  24.68 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  29.1 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  21.82 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.92 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  23.9 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  24.04 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.05 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>