245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0410 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  86.33 
 
 		 386 aa  675    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  100 
 
 		 373 aa  753    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  93.83 
 
 		 373 aa  691    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  59.95 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  55.26 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  55.14 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  56.44 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  53.91 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  55.92 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  55.92 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  48.51 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  48.66 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  47.64 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  46.15 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  46.67 
 
 		 372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  46.7 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  41.96 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  43.78 
 
 		 370 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  42.44 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  42.67 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  41.82 
 
 		 403 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  39.84 
 
 		 401 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  39.03 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  44.35 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  44.41 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  40.58 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  43.02 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  41.58 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  44.54 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  40.42 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  40.42 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  42.42 
 
 		 688 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  41 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  39.5 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  41.55 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  42.42 
 
 		 689 aa  260  3e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  41.02 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  38.38 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  40.36 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  41.81 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  38.17 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  40.21 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  40.17 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  40.27 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  39.31 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  37.86 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  36.8 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  36.55 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.58 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  35.67 
 
 		 344 aa  179  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.33 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.87 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  29.1 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  26.83 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.96 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.96 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.59 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.86 
 
 		 483 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.82 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.17 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.28 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.63 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  23.22 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.8 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  23.56 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  23.56 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.56 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  21.61 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.76 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>