243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1354 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  100 
 
 
371 aa  745    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  25.96 
 
 
367 aa  116  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.16 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.68 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  25.58 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  25.75 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  26.54 
 
 
386 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
689 aa  110  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.02 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  25.33 
 
 
401 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
375 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
362 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  26.09 
 
 
384 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  26.8 
 
 
688 aa  106  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.59 
 
 
374 aa  106  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  28.2 
 
 
373 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  28.32 
 
 
373 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
358 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  26.41 
 
 
384 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.51 
 
 
375 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  23.94 
 
 
372 aa  102  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
358 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
396 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  26.65 
 
 
409 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  26.87 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.4 
 
 
375 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  27.89 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.18 
 
 
348 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.53 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  26.11 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  22.83 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  24.6 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  24.4 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
381 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.32 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  22.22 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
360 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  23.74 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.53 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.91 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.55 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  21.87 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.26 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  29.68 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  22.99 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.55 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  22.97 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  26.27 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  23.03 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.26 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  27.14 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.23 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  20.79 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  31.87 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  22.99 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.36 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.74 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  22.95 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.64 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.48 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  25.51 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.78 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  21.57 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  22.31 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  23.25 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  21.99 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.3 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  25.59 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.33 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.06 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.44 
 
 
483 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.31 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.07 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  22.96 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  23.58 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  25.97 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  22.1 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  22.55 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  25.85 
 
 
357 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  24.02 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.43 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  22.75 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  21.19 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  23.19 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>