114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0816 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  100 
 
 		 344 aa  699    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  37.91 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  37.61 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  37.07 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  34.36 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.83 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  36.48 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  36.01 
 
 		 386 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  37.1 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  35.67 
 
 		 373 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  37.07 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  34.6 
 
 		 409 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  34.95 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  34.65 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  33.54 
 
 		 688 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  33.14 
 
 		 369 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  33.13 
 
 		 689 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  30.94 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  31.1 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  30.72 
 
 		 374 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  30.41 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  31.87 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  30 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  32.25 
 
 		 401 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  30.61 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  31.66 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  30.09 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  31.34 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  30.95 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  28.84 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  32.24 
 
 		 384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  30.91 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  31.17 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  29.33 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.85 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  25.88 
 
 		 381 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  27.13 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  25.53 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  25.72 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.9 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2350  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.91 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.71 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.61 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  22.38 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0166  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.15 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.11 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  24.38 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.38 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1789  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  21.2 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.2 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  24 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  22.62 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.49 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  20.63 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  23.84 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  21.51 
 
 		 682 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.38 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>