251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1622 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  100 
 
 		 370 aa  755    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  58.84 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  51.79 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  48.48 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  51.03 
 
 		 370 aa  355  5e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  51.29 
 
 		 384 aa  355  5e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  50.14 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  48.27 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  45.12 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  45.98 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  47.93 
 
 		 373 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  44.57 
 
 		 370 aa  318  9e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  40.85 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  40.32 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  38.46 
 
 		 386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  39.31 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.3 
 
 		 374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  37.01 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  41.6 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38.95 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  41.87 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  38.21 
 
 		 369 aa  262  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.93 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  38.54 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  37.87 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.69 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  38.17 
 
 		 372 aa  238  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  38.69 
 
 		 409 aa  232  6e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  39.47 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  34.84 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  37.38 
 
 		 381 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.86 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  38.3 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  35.2 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  37.65 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.03 
 
 		 375 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  36.76 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 688 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  34.77 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 689 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  36.09 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  34.04 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  34.18 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  34.32 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  31.69 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.94 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  34.03 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.58 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  22.84 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.19 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  22.26 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  24.67 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  21.65 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  22.22 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  22.19 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  22.19 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  23.55 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.4 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  22.78 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.24 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  22.16 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  23.01 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.63 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.8 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  23.96 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>