250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0251 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  100 
 
 
369 aa  730    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  55.32 
 
 
378 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  51.64 
 
 
369 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  48.96 
 
 
374 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  54.3 
 
 
381 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  45.71 
 
 
358 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  42.62 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  45.15 
 
 
358 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  42.02 
 
 
373 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  41.69 
 
 
373 aa  299  6e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  41.02 
 
 
374 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  40.8 
 
 
372 aa  289  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  39.71 
 
 
365 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  40 
 
 
374 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  40.35 
 
 
373 aa  278  9e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.11 
 
 
369 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  43.6 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  35.85 
 
 
373 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  38.98 
 
 
372 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  38.3 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  39.3 
 
 
396 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.91 
 
 
688 aa  235  7e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  40.66 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  39.46 
 
 
689 aa  231  1e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.94 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  36.61 
 
 
370 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  37.9 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  36.63 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  35.07 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  35.57 
 
 
375 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.34 
 
 
373 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  36.44 
 
 
401 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  36.28 
 
 
384 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  32.95 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
386 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  33.54 
 
 
366 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.14 
 
 
367 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  31.69 
 
 
370 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  34.3 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.12 
 
 
376 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  33.73 
 
 
375 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  31.96 
 
 
375 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  33.23 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  35.73 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  34.33 
 
 
377 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
375 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  30.86 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  33.14 
 
 
344 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  31.59 
 
 
381 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  29.92 
 
 
378 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  27.35 
 
 
426 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.91 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  22.22 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  23.91 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
363 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.48 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  26.21 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.29 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  24.13 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.38 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25.47 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  23.22 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.11 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.76 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.69 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  23.12 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.31 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.15 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  23.7 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  23.86 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  23.51 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  23.55 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.96 
 
 
483 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  22.97 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.42 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.88 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.53 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.53 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.53 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25.3 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.91 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  24.49 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  22.87 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.18 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>