264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1869 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  93.52 
 
 		 401 aa  773    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  100 
 
 		 401 aa  817    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  81.3 
 
 		 403 aa  675    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  69.97 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  70.85 
 
 		 384 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  58.52 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  53.16 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  48.48 
 
 		 370 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  51.14 
 
 		 370 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  50.27 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  49.3 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  49.39 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  43.84 
 
 		 372 aa  288  8e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  39.69 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.79 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  39.4 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  38.57 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  41.71 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  44.54 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  38.54 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  43.95 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  39.39 
 
 		 374 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  40.25 
 
 		 378 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.22 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  37.94 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  38.85 
 
 		 375 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  36.97 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  40.11 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  40.43 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  37.82 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  41.53 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  38.23 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  41.86 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  41.59 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 390 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  38.72 
 
 		 372 aa  240  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  37.08 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  38 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  36.66 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  36.52 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  36.57 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  34.82 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 688 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  35.59 
 
 		 689 aa  200  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  36.63 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  34.64 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.59 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  33.63 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  32.25 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.42 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.75 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 353 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 351 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 361 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  24.59 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.19 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.41 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.01 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.01 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.12 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.32 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  22.78 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.2 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  22.82 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.59 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.7 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.79 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.43 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>