278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3056 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 
369 aa  761    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  52.41 
 
 
374 aa  357  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  51.06 
 
 
372 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  46.15 
 
 
373 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  46.28 
 
 
373 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  45.92 
 
 
386 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  47.53 
 
 
369 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  50 
 
 
358 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  49.13 
 
 
358 aa  329  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  44.11 
 
 
374 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  45.78 
 
 
365 aa  308  8e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  42.97 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  45.91 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  43.29 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  42.22 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  43.77 
 
 
372 aa  278  8e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  39.11 
 
 
369 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  37.22 
 
 
401 aa  259  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.39 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  42.48 
 
 
403 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  36.22 
 
 
401 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  39.22 
 
 
370 aa  249  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  40.96 
 
 
409 aa  248  9e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  38.69 
 
 
370 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  39.72 
 
 
386 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  41.07 
 
 
396 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  40.63 
 
 
384 aa  238  9e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  37.16 
 
 
387 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  40.54 
 
 
393 aa  236  3e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  36.6 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  39.49 
 
 
688 aa  235  8e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  40.6 
 
 
689 aa  233  6e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  40.35 
 
 
384 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  39.02 
 
 
373 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  39.88 
 
 
390 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  38.37 
 
 
374 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  36.76 
 
 
375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  37.35 
 
 
337 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  35.34 
 
 
376 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  34.95 
 
 
375 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  34.62 
 
 
375 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  34.02 
 
 
375 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  33.93 
 
 
362 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  35.14 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  35.04 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.59 
 
 
373 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  33.83 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  31.99 
 
 
378 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.02 
 
 
367 aa  169  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  34.33 
 
 
359 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
354 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.79 
 
 
354 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.61 
 
 
354 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.47 
 
 
334 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.17 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.32 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  29.13 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.59 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.23 
 
 
315 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.38 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.56 
 
 
344 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.73 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.86 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  28.15 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.04 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.12 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.53 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.85 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.3 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.86 
 
 
384 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.32 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.36 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.38 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.68 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.69 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.68 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.37 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.68 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  25.7 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  23.68 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.85 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  25.34 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.53 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>