More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2395 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 408 aa  837    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  56.96 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  45.77 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  44.05 
 
 		 438 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  38.46 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25 
 
 		 351 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 375 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.11 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.47 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.24 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  25.07 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.18 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  24.74 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  27.4 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.53 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.69 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  26.1 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.85 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  22.94 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  22.99 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  24.02 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  22.99 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  23.28 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  26.27 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  23.47 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  21.99 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  23.18 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  24.71 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  23.59 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  22.83 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  22.57 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 318 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.4 
 
 		 370 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  23.24 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.04 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25 
 
 		 682 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  27.14 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  22.7 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  22.25 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.29 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.79 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  23.25 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  22.31 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  22.65 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.2 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.73 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  24.15 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.23 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>