296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1058 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  83.74 
 
 		 369 aa  634    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  100 
 
 		 370 aa  762    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  75 
 
 		 368 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  65.72 
 
 		 371 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  59.26 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  59.26 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  59.26 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  41.58 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  41.58 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  41.58 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  42.53 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  35.83 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  35.73 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.63 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  33.97 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  33.62 
 
 		 375 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.47 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  33.71 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  35.24 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  35.96 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  40.91 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  34.63 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  33.61 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.28 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 378 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  32.15 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  32.69 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  33.24 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.31 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  34.68 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  33.62 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  36.31 
 
 		 365 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.37 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  30 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  31.01 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  32.05 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  32.96 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  31.58 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.46 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.03 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.45 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  25.81 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.94 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  21.81 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.32 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.14 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  24.34 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  22.25 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  23.42 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.92 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  25.57 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.19 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  23.73 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  21.91 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  22.46 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.51 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  21.75 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  22.5 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  23.41 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  21.87 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  23.06 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.93 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>