More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3000 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  100 
 
 		 369 aa  757    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  83.74 
 
 		 370 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  76.7 
 
 		 368 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  66.48 
 
 		 371 aa  501  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  60.4 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  60.4 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.4 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  42.28 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  42.28 
 
 		 389 aa  301  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  42.28 
 
 		 389 aa  301  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  42.94 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  35.73 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  35.73 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  32.88 
 
 		 375 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.17 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  32.97 
 
 		 375 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.76 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  33.98 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  36.29 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  41.19 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.34 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  36.29 
 
 		 370 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  33.24 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  33.52 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.42 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  37.54 
 
 		 365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  33.7 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  32.36 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  33.6 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30.5 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  34.28 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  32.86 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  33.51 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  31.81 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  31.36 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  33.03 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  32.43 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  30.47 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30.81 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  29.89 
 
 		 384 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  31.06 
 
 		 363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  30 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.93 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  28.15 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.11 
 
 		 483 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  20.67 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.8 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.47 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  24.73 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 409 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.42 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.52 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.71 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  21.89 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  22.1 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.41 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.06 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.58 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  22.13 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  24.63 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  22.88 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  25 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>