More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2758 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  100 
 
 		 373 aa  770    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  90.88 
 
 		 373 aa  716    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  84.76 
 
 		 375 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  84.49 
 
 		 375 aa  673    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  58.79 
 
 		 377 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  58.62 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  58.21 
 
 		 375 aa  434  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  48.57 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  48.29 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  45.38 
 
 		 386 aa  348  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  43.51 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  47.75 
 
 		 383 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  36.93 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  34.16 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  34.16 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  34.16 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.14 
 
 		 370 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  36.6 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  35.73 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  32.35 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.75 
 
 		 401 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  35.45 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  35.73 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  35.9 
 
 		 370 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  35.16 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  32.85 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  32.85 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.85 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  33.88 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  34.38 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  32.16 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  30.26 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  30.11 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.32 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  29.36 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  33.62 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  27.22 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  32.56 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  29.81 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.82 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  28.29 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  28 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  23.04 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 		 478 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.22 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.55 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.04 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 377 aa  89.4  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  25.74 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.1 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  22.25 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.54 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.56 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.64 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.59 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.59 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 689 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  23.97 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 688 aa  73.6  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  23.27 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.84 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.1 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>