208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1708 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  100 
 
 		 392 aa  798    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.24 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.91 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.02 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  30.61 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  28.09 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 407 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  29.91 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 375 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  25 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.71 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.44 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.44 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  23.26 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  21.88 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 372 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  22.78 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  27.7 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.06 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  21.53 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  21.19 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  21.61 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  21.81 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  23.45 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  21.37 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  23.16 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  20.11 
 
 		 366 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  20.11 
 
 		 366 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.11 
 
 		 366 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  23.34 
 
 		 409 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 688 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  22.07 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  21.21 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  22.16 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  20.67 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  22.86 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  26.38 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  23.56 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.38 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.29 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  22.08 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  22.85 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  18.44 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  23.69 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  22.09 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  20.45 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  22.06 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  19.67 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  22.53 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  21.77 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  21.89 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  22.35 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  23.97 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  20.59 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.01 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  22.82 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>