More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5522 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  100 
 
 		 361 aa  693    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  65.27 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  65.07 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  64.78 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  66.27 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  56.41 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  48.47 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  49.36 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  47.79 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  47.65 
 
 		 353 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  46.33 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  40.12 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  36.84 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  35.98 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  36.31 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  37.17 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  35.08 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  37.05 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  32.93 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  30.75 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  40.94 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  33.44 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  37.12 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.76 
 
 		 349 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  36.65 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.18 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  39.42 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  34.23 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  33.63 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  36.78 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  36.41 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  33.33 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  30.79 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  36.22 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  31.17 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  30.89 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  34.3 
 
 		 344 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  34.3 
 
 		 344 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  26.54 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  30.61 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  34.06 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  31.92 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.81 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  29.61 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.48 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.16 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.27 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  30.23 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.46 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.36 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.9 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  27.38 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  29.65 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.73 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.1 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.83 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  27.48 
 
 		 478 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.67 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.73 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 359 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>