275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0327 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  781    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  58.2 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  58.2 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  45.75 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  38.57 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  39.6 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  38.32 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  42.45 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  42.17 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  37.01 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  38.73 
 
 		 386 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  41.5 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  38.96 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.94 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  38.73 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  41.22 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  41.38 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  39.85 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  38.52 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  39.95 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  40.97 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  39.2 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  37.47 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.6 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  37.47 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  37.63 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  34.15 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  36.05 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  36.79 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  36.68 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  36.46 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  35.31 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  37.05 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  37.23 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  35.49 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  36.96 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.96 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  35.51 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  32 
 
 		 689 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  33.16 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  31.05 
 
 		 688 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  37.09 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  31.59 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  32.39 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.8 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  25 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 350 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.39 
 
 		 426 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  28.45 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.31 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  24.78 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.57 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.2 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  22.58 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.62 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.93 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.93 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>