More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1015 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  100 
 
 		 371 aa  767    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  64.31 
 
 		 370 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  67.61 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  64.85 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  60.28 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  60.28 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.28 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  40.27 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  40.27 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  40.27 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  39.94 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  37.71 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  35.14 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.8 
 
 		 406 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  35.54 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.68 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  35.54 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.33 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  33.51 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  34.1 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  39.2 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  36.99 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  32.18 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  34.96 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  32.49 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  31.95 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  32.66 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  32 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  34.49 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.77 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  31.65 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  31.2 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  31.56 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.57 
 
 		 384 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.45 
 
 		 427 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 363 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27 
 
 		 365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.03 
 
 		 429 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  25.65 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 		 478 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.69 
 
 		 483 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  21.61 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24.61 
 
 		 409 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.58 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  23.77 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  25 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.08 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  23.22 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.43 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  24.28 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.73 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.46 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.87 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  20.63 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  23.71 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.71 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.87 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  22.58 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  23.59 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>