172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1100 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  100 
 
 		 374 aa  776    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  78.13 
 
 		 375 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  73.26 
 
 		 372 aa  594  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  72.46 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  55.71 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  55.62 
 
 		 374 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.46 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  35.25 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  33.81 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  33.81 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  33.81 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  31.65 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  33.73 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  30.06 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  33.73 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.73 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  32.54 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  29.32 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  32.96 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  33.54 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  29.97 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.17 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  32.92 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  31.15 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.21 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  30.05 
 
 		 377 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  28.1 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.71 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.69 
 
 		 427 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28.92 
 
 		 429 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  28.1 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.69 
 
 		 483 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  21.21 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.76 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  25 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  23.83 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  22.99 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.7 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.3 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  24.01 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.01 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  19.79 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  23.58 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  21.89 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  22.42 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  21.82 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  21.63 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.32 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  21.31 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  24.15 
 
 		 723 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  22.94 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  22.51 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>