231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1074 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  31.1 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  30.4 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  28.21 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  33.48 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 277 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  23.7 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  21.93 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  22.14 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5677  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.71 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.91 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.74 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.46 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  27 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  24.48 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  24.48 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.09 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.09 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0791  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4256  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.74 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  27 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  22.78 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  26 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.6 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0632  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  24.46 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  24.83 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  27.24 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.34 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  23.27 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  25.66 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.96 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  24.18 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.03 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  27.07 
 
 		 478 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  23.58 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.1 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  24.32 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.87 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  24 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  23.3 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  22.67 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3279  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.34 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  23 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 723 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 723 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  23 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.04 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4774  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  24.22 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>