More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3341 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  100 
 
 		 335 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  28.21 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.58 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.61 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  27.92 
 
 		 286 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  21.48 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2513  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.95 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.88 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  22.66 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.87 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  29.27 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.65 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.88 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  21.95 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  24.55 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  21.95 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  21.95 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.94 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  26.83 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  22.49 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.94 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.27 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.21 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  21.6 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  22.3 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  25.25 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3342  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  22.37 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  22.4 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.91 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2324  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0524222  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  25 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  22.89 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  21.99 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0948  periplasmic binding protein  25 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.971026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1017  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.951283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4008  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1754  heme transporter protein HuvB, putative periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0993  periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00265339  hitchhiker  0.0000000000789145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.81 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  27.27 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  24.38 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  21.69 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  22.84 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3239  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  25 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  19.72 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>