267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0464 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  100 
 
 		 367 aa  763    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  43.27 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  32.1 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  27.94 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  28.23 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  21.82 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  21.53 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  21.61 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  21.9 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0745  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.124358  hitchhiker  0.00000000011582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  29.63 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.64 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0880  corrinoid ABC transporter substrate-binding protein  26.14 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  22.3 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 277 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.31 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  23.11 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  26.67 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  24.39 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0993  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00265339  hitchhiker  0.0000000000789145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.24 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.59 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  25 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 682 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  29.26 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.5 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  21.43 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  24.52 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0075  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0962  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4192  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0568253  normal  0.138797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3331  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.26 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3336  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383489  hitchhiker  0.00144742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3342  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 272 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  24.52 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_27  iron ion ABC transporter, periplasmic component  22.69 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0380632  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4836  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4774  periplasmic binding protein  24.27 
 
 		 302 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0219  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  24.62 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1017  periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.951283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  25 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.23 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5429  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1050  periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5433  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0579041  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  28.19 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.04 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4256  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 288 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  23.25 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>