169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1003 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  100 
 
 		 285 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  49.1 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  36.59 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  37.18 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  37.8 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  39.83 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  37.7 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  37.35 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  40.76 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  35.02 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0791  periplasmic binding protein  36.58 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  34.63 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0632  periplasmic binding protein  34.26 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  32.92 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  33.47 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  33.88 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4256  periplasmic binding protein  37.74 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0734  periplasmic binding protein  35.32 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0087  periplasmic binding protein  36.51 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  34.39 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3279  periplasmic binding protein  37.74 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  33.72 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5677  periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  32.74 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1340  putative ferrichrome binding protein of ABC transporter  34.9 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.40486  normal  0.404265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1187  periplasmic binding protein  35.27 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  35.04 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  32.21 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  32.04 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2513  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.1 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3090  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.07 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.08 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  22.84 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  32.57 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.22 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  32.69 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3535  periplasmic binding protein  25 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.862472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.53 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1763  hemin-binding periplasmic protein HmuT  28.06 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.34 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  22.3 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  26 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 342 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3565  periplasmic binding protein  32.35 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1508  periplasmic binding protein  23.96 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.68 
 
 		 483 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09830  ABC-type hemin transport system, periplasmic component  28.37 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  23.14 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  24.63 
 
 		 354 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1739  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.102964  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  22.55 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  31.75 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 406 aa  49.3  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 363 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3879  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 379 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  20.72 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0371  periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>