107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1827 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  79.21 
 
 		 279 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  78.49 
 
 		 279 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  46.4 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  46.4 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  43.54 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  45.6 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  46.24 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  48.66 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  44.62 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  34.87 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  36.61 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  33.98 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  34.94 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  35 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  33.47 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  32.46 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5677  periplasmic binding protein  34.58 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0791  periplasmic binding protein  34.02 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  32.41 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  32.28 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  32.54 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0734  periplasmic binding protein  34.55 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  30.8 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1340  putative ferrichrome binding protein of ABC transporter  29.77 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.40486  normal  0.404265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4256  periplasmic binding protein  33.6 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0632  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0087  periplasmic binding protein  33.59 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3279  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  32.96 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1187  periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3090  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.03 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  24.62 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  27 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  31.37 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  22.69 
 
 		 354 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1508  periplasmic binding protein  27.4 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.05 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  26.28 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.19 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2513  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.41 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.88 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  21.85 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.63 
 
 		 356 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0585  periplasmic binding protein  28.97 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4800  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000643232  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0745  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.124358  hitchhiker  0.00000000011582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  24.88 
 
 		 517 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3535  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.862472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7224  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 404 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  20.24 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4008  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3454  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0575769  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 306 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  24.46 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62300  hypothetical protein  27.78 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0763709  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.1 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  22.86 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2411  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  22.01 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 409 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  22.29 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 689 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  23.37 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  22.41 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>