79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3090 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3090  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 270 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  35.18 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  32.3 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  35.75 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  33.18 
 
 		 286 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  31.4 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  34.12 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  35.23 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1340  putative ferrichrome binding protein of ABC transporter  32.72 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.40486  normal  0.404265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  34.55 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  34.55 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.08 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.47 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  31.12 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2513  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.92 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0791  periplasmic binding protein  32.75 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  34.03 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  30.93 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5677  periplasmic binding protein  33.53 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  29.41 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  32.98 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0438  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.98 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0826  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.98 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2092  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.98 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0345  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.93 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1778  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.93 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1118  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.98 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403801  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1828  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  31.98 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0632  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1187  periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  29.05 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2134  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342061  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0734  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4203  periplasmic binding protein  29.33 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.564967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4256  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  20.48 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  28.11 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3279  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  26.34 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 362 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0219  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  30.65 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2141  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.27 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  25.81 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  23.15 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4836  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  20.77 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  23.15 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5433  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0579041  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5429  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3565  periplasmic binding protein  28.31 
 
 		 360 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.93 
 
 		 483 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3773  periplasmic binding protein  32.71 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3891  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0648  hemin-binding periplasmic protein  29.63 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3803  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  29.63 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.656087  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5317  periplasmic binding protein  29.61 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4774  periplasmic binding protein  31.17 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3336  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383489  hitchhiker  0.00144742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  29.44 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  20.16 
 
 		 339 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0807  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0053  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>