54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2513 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2513  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 293 aa  573  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  27.95 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3090  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.57 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5677  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  29.25 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.7 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.59 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.54 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  24.27 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0734  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0791  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  20 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  22.09 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  24.41 
 
 		 354 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0632  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  21.46 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  22.76 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.72 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001352  periplasmic hemin-binding protein  25.65 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00152627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  27.12 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1713  periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.917384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  28.5 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 377 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  20.79 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  20.29 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3279  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  21.57 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 682 aa  42.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>