More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1584 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  74.81 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  37.71 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.61 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3569  periplasmic binding protein  39.26 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135513  hitchhiker  0.00885259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  32.12 
 
 		 321 aa  99  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  31.65 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 315 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  32.51 
 
 		 379 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 312 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 351 aa  95.9  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 341 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 293 aa  92.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1171  hypothetical protein  32.47 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.51603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  31.01 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11530  hypothetical protein  35.05 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  34.54 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  32.54 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.24 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.92 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0127  hypothetical protein  32.77 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0384146  hitchhiker  0.00530729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1210  periplasmic binding protein  34.16 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2246  hypothetical protein  30.58 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155088  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.7 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.51 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  34.62 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.66 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  33.5 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  31.54 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.75 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  34.43 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.27 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0131  hypothetical protein  31.46 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.881561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  27 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.05 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3091  periplasmic binding protein  30.88 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.89 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.72 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  28.12 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2103  hypothetical protein  29.34 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000719716  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0102  hypothetical protein  31.47 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000654219 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  30.58 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  30.85 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0786  vitamin B12-transporter protein BtuF  25.9 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  33.84 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0135  hypothetical protein  30.51 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.24 
 
 		 338 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.24 
 
 		 338 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2834  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  32.98 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  30.64 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  33.52 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  32.88 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2810  hypothetical protein  27.76 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  31.31 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  31.79 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  28.89 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  33.51 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  30.37 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  26.4 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  23.36 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  29.85 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0010  putative periplasmic substrate-binding protein  26.1 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.35 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.4 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>