121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3050 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3728  periplasmic binding protein  74.58 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0632  periplasmic binding protein  64.59 
 
 		 279 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0791  periplasmic binding protein  61.35 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  59.11 
 
 		 295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0734  periplasmic binding protein  62.55 
 
 		 279 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4256  periplasmic binding protein  58.99 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2371  periplasmic binding protein  56.44 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0087  periplasmic binding protein  63.98 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3279  periplasmic binding protein  59.6 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  35.07 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  35.14 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  35.1 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  37.12 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  35.77 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  35.77 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  32.59 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  36.07 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  36.07 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  32.69 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  33.07 
 
 		 278 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  36.02 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  32.82 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6078  periplasmic binding protein  31.7 
 
 		 277 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3153  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2928  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1340  putative ferrichrome binding protein of ABC transporter  31.25 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.40486  normal  0.404265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3806  periplasmic binding protein  31.08 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1187  periplasmic binding protein  34.96 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0509  periplasmic binding protein  31.78 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5677  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3080  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.81 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  27.27 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0880  corrinoid ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  27 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  25.66 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2513  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.25 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7224  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  25 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3090  iron compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.21 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  23.2 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2386  binding-protein-dependent transport lipoprotein  24.54 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8855  periplasmic binding protein  27 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.461733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.66 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  21.5 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2141  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.99 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.78 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3535  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.862472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.57 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0345  periplasmic binding protein  30 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.97 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1828  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.09 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0826  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.09 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1118  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.09 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403801  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2092  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.09 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0345  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.09 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1778  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.09 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0438  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  30.56 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1754  heme transporter protein HuvB, putative periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122472  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  24.56 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.56 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3879  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  23.37 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00157  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.36 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00156  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3444  periplasmic binding protein  23.83 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0162  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.83 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0163  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.83 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 377 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3501  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.83 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0170  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.83 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4008  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0168  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.36 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.16 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  22.57 
 
 		 341 aa  45.8  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  20.99 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.84 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0786  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.683071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  28.89 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  23.61 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>