More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0978 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  100 
 
 		 689 aa  1391    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  94.63 
 
 		 688 aa  1314    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  85.88 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  83.82 
 
 		 393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  66.38 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  48.99 
 
 		 374 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1399  hypothetical protein  53.7 
 
 		 315 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  46.2 
 
 		 374 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  45.11 
 
 		 378 aa  293  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  46.43 
 
 		 369 aa  287  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  43.88 
 
 		 381 aa  275  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  43.66 
 
 		 358 aa  266  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  43.55 
 
 		 358 aa  259  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  43.2 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  43.36 
 
 		 373 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  41.14 
 
 		 386 aa  257  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  38.83 
 
 		 374 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  38.76 
 
 		 372 aa  242  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  38.83 
 
 		 374 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  38.83 
 
 		 365 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1509  hypothetical protein  43.59 
 
 		 328 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  40.94 
 
 		 373 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.27 
 
 		 373 aa  234  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40.6 
 
 		 369 aa  233  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  39.46 
 
 		 369 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  36.57 
 
 		 372 aa  218  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  37.19 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  37.6 
 
 		 375 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 370 aa  208  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  35.59 
 
 		 401 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  34.93 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  37.06 
 
 		 370 aa  201  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  37.43 
 
 		 384 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  35.59 
 
 		 401 aa  200  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  36.86 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  37.9 
 
 		 362 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  34.55 
 
 		 375 aa  194  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  34.17 
 
 		 387 aa  193  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  33.9 
 
 		 375 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  36.39 
 
 		 373 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  33.06 
 
 		 377 aa  178  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.78 
 
 		 376 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  33.62 
 
 		 386 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  32 
 
 		 381 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  33.13 
 
 		 344 aa  161  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 366 aa  161  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  33.53 
 
 		 359 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  31.34 
 
 		 337 aa  151  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  30.21 
 
 		 367 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  28.24 
 
 		 378 aa  126  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 375 aa  114  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 371 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 315 aa  99.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30 
 
 		 427 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 315 aa  95.5  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.07 
 
 		 426 aa  95.1  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 		 478 aa  91.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 363 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 407 aa  90.5  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 354 aa  89.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 333 aa  88.6  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 354 aa  88.2  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 368 aa  87.8  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 380 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.05 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.59 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 375 aa  80.1  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.4 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.86 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  27.15 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  27 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 361 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 377 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.03 
 
 		 406 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  23.75 
 
 		 370 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.4 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.11 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 682 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>