More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2027 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  100 
 
 		 378 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  95.24 
 
 		 378 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  48.02 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  51.73 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  48.39 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  47.58 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  46.79 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  48.29 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  48.29 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  49.04 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  43.24 
 
 		 386 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  42.47 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  38.27 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  37.63 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  37.63 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  37.63 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  33.15 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.93 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  36.52 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  32.38 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  33.71 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  33.61 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  32.19 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.64 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  31.93 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  31.93 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.93 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  32.48 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  33.52 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  31.66 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.84 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  30.32 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  27.75 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  31.43 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  28.45 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  27.25 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  30 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.48 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30.33 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  26.58 
 
 		 517 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  24.49 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.68 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  28.61 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.66 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.81 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.6 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  22.09 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.8 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  24.72 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  22.84 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  21.96 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  22.16 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.26 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  23.82 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  24.46 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  27.34 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  22.35 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>