More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 386 aa  781    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  46.58 
 
 		 341 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.17 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  43.99 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  41.74 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.73 
 
 		 372 aa  254  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  38.23 
 
 		 351 aa  224  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  37.04 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  37.69 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  39.06 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  36.2 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  35.07 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  31.8 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  32.31 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  32.92 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  33.97 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.34 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  29.06 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  29.94 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.27 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.32 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  28.11 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  30.84 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  29.59 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  30.06 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  29.97 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10530  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.54 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 334 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  28.41 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.71 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.58 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  27.14 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  26.98 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.14 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  29.74 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 682 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 682 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  28.41 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 354 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.72 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  28.49 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  26.59 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.7 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 375 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.35 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 315 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  28.99 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  28 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.91 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  29.07 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  23.6 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.43 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.43 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  30.71 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  27 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>