228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2147 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  100 
 
 		 387 aa  804    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  58.84 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  53.16 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  51.36 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  52.01 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  50.29 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  50.45 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  49.86 
 
 		 384 aa  342  7e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  48.44 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  49.86 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  43.47 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  48.41 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  39.23 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  43.89 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  41.9 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  42.53 
 
 		 373 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  42.28 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  40.73 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  39.43 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  40.62 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  39.89 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  41.55 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  37.83 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.62 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  38.73 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  37.82 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.16 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.81 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  38.76 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  39.65 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  39.3 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  37.75 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  39.12 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  38.71 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.21 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  37.28 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  36.52 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  35.69 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 688 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  34.17 
 
 		 689 aa  194  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  32.95 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  34.12 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  30.45 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 350 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  24.85 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  21.91 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.29 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 351 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.38 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.77 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.08 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.28 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  22.01 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  22.64 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.11 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  22.55 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.46 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.12 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.4 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  25.07 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  23.25 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  23.21 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  23.21 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.8 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.69 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  22.36 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>