245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2329 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  100 
 
 		 384 aa  781    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  88.68 
 
 		 384 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  64.74 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  62.34 
 
 		 401 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  62.86 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  60.81 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  50.14 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  47.51 
 
 		 370 aa  345  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  49.04 
 
 		 387 aa  342  8e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  47.53 
 
 		 370 aa  338  7e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  47.89 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  42.35 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  41.56 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  44.99 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  41.53 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  40.11 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  40 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  39.73 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  40.05 
 
 		 374 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  37.96 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  39.94 
 
 		 373 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  38.89 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  40 
 
 		 378 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  38.2 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  42.11 
 
 		 358 aa  249  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  40.05 
 
 		 375 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  42.69 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  40.48 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  40.27 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  39.78 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  38.9 
 
 		 378 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40.29 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  42.48 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  38.32 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  37.6 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  38.57 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  37.69 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  37.39 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  38.83 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  36.57 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  36.46 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  36.75 
 
 		 396 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  35.33 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  36.6 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  36.09 
 
 		 689 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  35.99 
 
 		 688 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  35.51 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  32.96 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  35.44 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 478 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.7 
 
 		 483 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 350 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.72 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.14 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.92 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.94 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.21 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.45 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.99 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.45 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  23.62 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.75 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  23.81 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.79 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>